大家看看怎么做比较好？

两个不同的数据库，比较其中某些表的数据。同时要把不同的数据以表格形式输出。
请问，两个表中的数据比较，用什么算法比较快？
总觉得用 其中一个表的一条记录，然后遍历比较另一个表中的数据。这样比较慢。
请赐教。