关于ClassLoader的问题

最近在看ClassLoader，有个问题，我自定义了一个ClassLoader，是扩展自URLClassLoader的，它的父ClassLoader是AppClassLoader，其中重写了findClass和loadclass两个方法，重写的时候仍然是，先在ClassLoader中查找是否已经加载，没有加载，代理给父类加载，父类没有加载，然后就自己加载，在主线程中，重启了一个线程，而且用Thread的setClassLoader方法，把我自定义的ClassLoader设置为这个线程的ClassLoader，用显示的类加载方法，可以加载我自定义的一些类，但是如果用隐式的方式，也就是来new这个类的一个实例，或者用加载的class来创建这个类的一个实例，也就是用class类的newInstance()方法，用反射是可以调用类的方法的， 就不能加载，就会抛出NoClassDefFoundError这个错误(这自定义的类，不在classpath里面，但是在我自定义的ClassLoader的查找的url里面)，出现这个问题的原因是这个问题。
但是我看那些Servlet容器，应用服务器，像Tomcat，定义了很多的ClassLoader，不同的ClassLoader负责不同的路径类的加载，在我们定义的Servlet，jsp里面是可以来new自定义的类的实例的，而这些类也并不在classpath中。