AI虚拟实验室横空出世:92种新冠纳米抗体横扫变异病毒!

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科学家们发明了一个超级酷的东西叫"虚拟实验室"!这就像开了个"AI科学家天团",里面有个"AI首席研究员"当队长,带着一群"AI科学家队员"开研究会议,还有真人科学家在旁边指导和提建议。

他们用这个"AI天团"干了件大事——专门对付那个让全世界头疼的新冠病毒变异株!这些AI科学家们想出了一个超厉害的新方法,设计出了92种全新的"纳米抗体"(就是一种超级小的抗体,小到可以钻进病毒身体里搞破坏)。

最牛的是,他们真的做实验验证了这些AI设计的抗体,发现好多都超级好用!特别是有两种新抗体,对付最新的JN.1和KP.3变异病毒特别厉害,同时还能很好地抓住原来的病毒,简直就是"全能选手"!


虚拟实验室是人工智能与人类合作开展科学研究的平台。在虚拟实验室中,一位人类研究员与一组大型语言模型 (LLM)代理合作开展科学研究。人类研究员与 LLM 代理之间的互动通过一系列团队会议进行,在会议中,所有 LLM 代理共同讨论人类研究员提出的科学议程;在个人会议中,人类研究员与单个 LLM 代理互动,以解决特定的科学任务。

请参阅我们的论文《虚拟实验室:AI 代理设计新的 SARS-CoV-2 纳米抗体并进行实验验证》,了解有关虚拟实验室的更多详细信息以及 SARS-CoV-2 纳米抗体设计的应用。

纳米抗体设计虚拟实验室
作为实际演示,我们利用虚拟实验室 (Virtual Lab) 设计了针对 SARS-CoV-2 最新变体之一的纳米抗体(参见nanobody_design)。虚拟实验室构建了由ESMAlphaFold-MultimerRosetta组成的计算流程,并利用该流程设计了 92 个经过实验验证的纳米抗体。

请参阅笔记本nanobody_design/run_nanobody_design.ipynb,了解如何使用虚拟实验室创建代理以及运行团队和个人会议的示例。


虚拟实验室目前使用 OpenAI 的 GPT-4o。请将您的 OpenAI API 密钥保存为环境变量OPENAI_API_KEY。例如,将其添加export OPENAI_API_KEY=到您的.bashrc或 中.bash_profile。