代谢和mRNA翻译之间的相互影响

研究细胞代谢和mRNA翻译性之间的关系,对于我们理解许多器官中不同细胞类型如何感知代谢物的可用性以促进其生长、存活和分化至关重要。

Cell的最新文章《代谢和mRNA翻译之间的串扰》:https://www.cell.com/cell-metabolism/fulltext/S1550-4131(24)00324-3

细胞中最耗能的过程

  • 代谢和 mRNA 翻译是调节基因表达和细胞生理的关键步骤。
  • 这个步骤是细胞中最耗能的过程
  • mRNA 翻译与细胞代谢密切相关且同步。

mRNA翻译是代谢的协调者:

  • 代谢途径的几种 mRNA 在翻译水平上受到调控
代谢反过来影响 RNA 生物学的几个方面:
  • 代谢途径和代谢物直接控制翻译机制的选择性和效率
  • RNA 的转录后修饰以微调蛋白质合成
翻译控制和细胞代谢之间错综复杂的相互作用的改变已成为人类疾病的关键轴。更好地了解此类事件将预见人类疾病状态的创新治疗策略。

营养物质

  • 大量文献表明,营养物质通过激活特定的信号通路来影响翻译,其中最受认可的是mTOR通路。
  • 营养物质缺乏和应激信号也将翻译和代谢联系起来。

在本综述中:

  • 首先总结翻译机制以及特定代谢途径如何进行翻译调控。
  • 然后,我们将讨论代谢和代谢状态如何在翻译水平上影响基因表达。

几种代谢过程:

  • 铁代谢是第一个在翻译水平上受控的途径。
  • 多胺亚精胺是一种聚阳离子,在细胞生长和增殖中发挥作用并促进长寿。​​​​羟丁酸是一种来自多胺亚精胺的不寻常氨基酸,多胺代谢的背景下,整个多胺途径通过典型和非典型机制受到复杂的翻译控制。
  • 硒代谢与翻译密切相关。在生命的所有领域中,必需的微量元素硒在 mRNA 翻译过程中以氨基酸硒代半胱氨酸 (Sec) 的形式被整合到硒蛋白中。硒蛋白缺乏和硒蛋白突变会导致全身性疾病。
  • 脂质代谢在翻译起始水平上受到广泛控制。生酮的整个代谢途径(禁食期间发生的代谢转换)处于翻译控制之下。
  • 二甲双胍是一种广泛使用的药物,在药理浓度下可激活 AMPK,二甲双胍在 mRNA 翻译水平上控制基因表达的程度与典型的 mTOR 抑制剂相当

代谢结果:代谢物
代谢物是处于翻译和交叉点。

营养物质或代谢物的局部存在如何影响翻译输出?

  1. 原核生物已经发展出嵌入特定 mRNA 的结构化非编码区,称为核糖开关。感知特定代谢线索的存在
  2. 真核生物没有核糖开关;然而,细胞代谢和营养线索会影响涉及翻译机制的所有 RNA 类型的修饰,例如 mRNA、tRNA 和 rRNA。
不同种类的 RNA 上存在与代谢相关的修饰,并影响翻译过程,但其调控功能尚不清楚:
  • 一碳 (1C) 代谢支持不同的生理过程,例如氧化还原防御、表观遗传维持以及嘌呤和特定氨基酸的生物合成,包括甘氨酸、丝氨酸和蛋氨酸。
  • 哺乳动物细胞中叶酸 1C 单位的另一个主要来源是氨基酸丝氨酸,它提供甲基供体

翻译控制失调是癌症发生和发展的标志,是与异常代谢、存活、血管生成和免疫反应改变有关。

近几年出现的一个令人惊讶的概念是翻译和代谢重塑,它使癌细胞能够在几种不利条件下存活。已经有人综述了饥饿如何通过翻译重编程充当癌症转移的驱动力。

心血管细胞是代谢异质组织,因为它们需要适应其所处的不同微环境。

  • 血管内皮生长因子 (VEGF) 和 VEGFR2 都是血管生成的主要调节因子,已被发现处于特定的翻译控制之下 

T 细胞的生命受免疫代谢调节。淋巴细胞预先积累了几种代谢 mRNA,这些 mRNA 在 T 细胞受体(TCR) 参与后被翻译激活。T 细胞拥有强大的糖酵解机制,当呼吸受阻(例如缺氧时)时,该机制可用于代谢转换。在淋巴细胞中,从静止到活化的转变导致蛋白质合成增加数倍;特定的 mRNA 翻译随后驱动特定的代谢过程,例如脂质合成和糖酵解。

代谢的翻译控制影响在代谢综合征中很明显,代谢综合征是一组以高血糖和高甘油三酯水平为特征的疾病。
肝脏处于两个显著观察的交叉点:

  • 一方面,它是哺乳动物中蛋白质合成率最高、调节多种代谢过程的器官;
  • 另一方面,它是成年人中再生能力最强的器官。
代谢综合征常常伴有非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD)。

总结
本文深入探讨了翻译控制与细胞代谢之间的紧密联系,以及这种联系在细胞适应动态环境中的重要性。

  • 翻译控制的快速响应: 相比转录控制,翻译控制能更迅速地调节蛋白质合成,从而使细胞能够快速适应不断变化的代谢需求。
  • 技术瓶颈: 目前,我们对翻译控制的理解还存在一些技术上的限制,特别是单细胞水平上的研究。
  • 代谢物对翻译的调控: 代谢物不仅为蛋白质合成提供原料,还可以直接结合蛋白质或RNA,调节翻译过程。
  • 组织特异性: 不同组织的翻译控制机制可能存在差异,以适应各自的代谢需求。
  • 疾病中的翻译控制: 翻译控制在多种疾病,如癌症,中起着重要作用。